Étude de la diversité métabolique des microorganismes des sources hydrothermales océaniques

Depuis la découverte des sources hydrothermales océaniques, la diversité microbienne de cet environnement a été étudiée en utilisant des approches culturales et moléculaires. Dans cette étude la diversité microbienne d’édifices hydrothermaux prélevés des sites TAG et Lucky Strike (Dorsale Médio-atlantique) a été étudiée par la réalisation d’inventaire moléculaires et de culture d’enrichissement en continu en bioréacteur. Afin de se rapprocher au mieux des conditions environnementales, les cultures ont été réalisées en condition et en présence d’hydrogéne et de dioxide de carbone ou en utilisant un mélange fluide hydrothermal/eau de mer comme milieu de culture. L’effet de changements environnementaux tel que la température et la présence ou l’absence de soufre a également été testé. La diversité des Archaea et des Bacteria a été étudiée aussi bien dans les échantillons que dans les cultures. Les analyses des séquences du gène codant pour l’ARNrlSS ont mis en évidence des micro-organismes affiliées aux Archaeoglobales, Thermococcales, Desulfurococcales, Deferribacterales et Thermales suivant les conditions de cultures. L’effet des changements environnementaux, la température, les donneurs et accepteurs d’électrons conditionnent la composition des communautés cultivées, comme cela peut se produire dans l’environnent. Dans une deuxième partie de cette étude, nous avons étudié le rôle du métabolisme anammox dans les écosystèmes hydrothermaux. La présence et l’activité de bactéries anammox ont été montrées dans ces environnements par l’amplification du gène codant pour I’ARNr16S de micro-organismes anammox, et des mesures d’activité de production de 14N-15N à haute température.